Sebastián León wurde in Bogotá geboren, wo er sein Hochschulstudium an der Pontificia Universidad Javeriana begann. Später absolvierte er einen Bachelor- und Masterabschluss in Musik an der renommierten Schola Cantorum Basiliensis (Schweiz), wo er sich auf die Interpretation historischer Repertoires vom Mittelalter bis zur Romantik spezialisierte.
Gelobt für seinen „klaren Klang, direkte Projektion und makellose Stimmführung und Diktion“ (Diapason), trat er als Solist und in Ensembles mit namhaften europäischen Gruppen auf – darunter La Morra, Gli Incogniti, Les Talens Lyriques, Al Ayre Español und Scherzi Musicali –, die sich der mittelalterlichen, Renaissance- und Barockmusik widmen. Er ist Gründer und Leiter des Ensembles La Boz Galana, das sich der Wiederentdeckung und Aufführung spanischen und iberoamerikanischen Repertoires (15.–18. Jahrhundert) verschrieben hat, sowie Gründer und Gastdirigent von Convivium Musicum Zürich, das auf deutsche Sakralmusik des 17. und 18. Jahrhunderts spezialisiert ist. Zu seiner Diskografie gehören Zusammenarbeiten mit Labels wie Glossa, Ramée, Lindoro, Brilliant Classics und Musiques Suisses sowie Auftritte bei Schweizer Radio und Spanischem Rundfunk (RTVE).
Neben seiner musikalischen Laufbahn hat León einen Doktortitel in Literatur- und Kulturwissenschaften von der Universität Barcelona. Er wurde eingeladen, Vorträge und Kurse an Institutionen wie der Yale University, der Universität Basel, der Renaissance Society of America und der Universidad Javeriana zu halten. Seine Ausbildung rundete er mit Kursen in Editorial Design an der Basler Schule für Gestaltung ab.
Aktuell koordiniert er die Plattform Diversas Rimas (diversasrimas.com), ein Projekt, das sich der mündlichen Vermittlung – durch Rezitation und Gesang – des hispanischen Literaturerbes des Goldenen Zeitalters widmet. Zudem arbeitet er als Forscher, Interpret und musikalischer Leiter mit der klassischen Puppentheaterkompanie La Máquina Real zusammen und verbindet so seine künstlerischen und akademischen Interessen.